知网查重会留下痕迹的原因主要是因为知网系统会记录用户的查重历史，包括上传的文档信息、查重结果等。这些信息会在系统中留下痕迹，导致后续查重时被系统检测到重复。为避免留下痕迹，可以尝试使用不同账号进行查重，避免重复上传相似文档。另外，可以尝试对文档进行适当的修改，改变文档结构和内容，降低被查重系统检测到的概率。

另外，还可以尝试使用一些专业的查重软件，如Turnitin等，这些软件具有更高的查重准确性和保密性，可以有效避免知网查重留下痕迹的问题。此外，也可以尝试使用一些在线的文档处理工具，对文档进行格式调整、内容优化等操作，提高查重通过率，降低留下痕迹的风险。综上所述，了解查重留下痕迹的原因并采取相应的解决方法，可以有效提高查重通过率，避免不必要的麻烦。